Specyfika sektora zdrowia powoduje, że wiele z metod i narzędzi zarządzania opisanych w podręcznikach akademickich, nie znajduje w tej branży praktycznego zastosowania. Szczegółowemu wyjaśnieniu tego zagadnienia poświęcony jest osobny wykład w ramach Prometricum MBA w ochronie zdrowia.

Jako najważniejsze przyczyny wymienić należy powszechność ubezpieczeń zdrowotnych (pacjent w systemie publicznym nie pokrywa bezpośrednio kosztów udzielonych mu usług) oraz trudność w pomiarze jakości realizowanych świadczeń. Menedżerowie ochrony zdrowia nie mają do dyspozycji wielu informacji oczywistych dla menedżerów innych branż, a przez to w niektórych sytuacjach muszą działać inaczej.

Program Prometricum MBA w ochronie zdrowia oparty jest na programie TOTAL MBA McGraw Hill (a zatem słuchacze poznają klasyczne reguły zarządzania), który jest przedstawiony przez praktyków sektora zdrowia oraz uzupełniony o przedmioty typowe dla tej branży, takie jak ocena technologii medycznych, programy zdrowotne, koordynowana opieka zdrowotna, interoperacyjność systemów IT w ochronie zdrowia itp.